Abstract : Single cell RNAseq은 세포별 이질성(heterogeneity)을 특정화 할 수 있는 방법이지만, 현재는 규모가 큰 샘플 코호트에서는 관행적이지 않으며 일반적인 임상 치료 방법으로 모은 고정된 검체에서는 적용할 수 없다. Digital cytometry 방법인 CIBERSORT 는 bulk tissue transcriptomes 에서 cell type 별 abundances를 추정할 수 있는데, 논문에서 소개하는 CIBERSORTx는 물리적인 cell isolation 없이 cell-type-specific 하게 gene expression profiles 을 추정하는(infer) 머신러닝 방법을 사용하였다.
CIBERSORTx 는 platform-specific한 변수를 최소화함으로서 대규묘 tissue dissection 으로부터 single-cell RNAsequencing 을 사용할 수 있도록 해준다. Introduction : 조직들은 기능들...
원문 링크 : 논문분석)Cibersortx
