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(web) Search to Genomic sequence (Using UCSC, NCBI)

 (web) Search to Genomic sequence (Using UCSC, NCBI)

1. Gene의 전체 genomic sequence(.fasta)를 알고 싶은 경우 : NCBI와 UCSC를 사용하면 된다.

-NCBI 1) gene 찾기 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene 에서 gene 을 검색한다. 2) Reference 선택 reference는 hg38, hg19가 있는데 이전 microarray부터 연구부터 쌓인 정보들은 hg19에 있어서 hg38을 reference로 사용한 경우, 사용할 수 없는 정보들이 있다. 보통 mapping에 hg19를 사용한다.

NP랑 NM이 1:1 매칭이거나 보통 더 많다.(이유가 궁금하면 쪽지주세요) 보고싶은 NM에 마우스를 올려두면 이런식으로 박스가 뜰텐데, 보고싶은 서열을 확인하면 된다.

이렇게 하면 정방향의 sequence가 검색이 된다. -UCSC 1) gene 검색 https://genome...........