1. parse PLS discriminant analysis(sPLS-DA) 란 PLS (Partial Least Squares Regression) 목적 : PLS 를 통한 demension 축소 PCA는 Total feature를 통해 분류하지만, PLS 는 feature 와 class 까지 고려한 뒤 rotation을 진행하여 feature가 늘어선 방향이 class 와 잘 일치하는 co-variance 를 찾아주면 samples이 class 에 따라 Clustering 되는 방식을 볼 수 있음. 결국 PCA 기반 regression도 가능하겠지만, Class 에 대한 걸 요구하지 않고 total-variance 만 따지기에 class를 잘 나눌 수 있는 방식을 사용하였음.
DA (discriminant analysis) 유전자 > 샘플 수 인 경우, overfitting 이 생길 수 있어 모델을 구축하게 되면 어떤 결과물도 맞출 수 있게 됨. Heatmap 상 같은 clus...
원문 링크 : sPLS-DA
