RNAseq) edgeR -1

edgeR : Count table 을 받아서 DEG 계산가능 1) DGEList > edgeR 에서 데이터를 효율적으로 사용할 수 있도록 List-based data 형태로 변환시켜주는 옵션 edgeR stores data in a simple list-based data object called a DGEList. This type of object is easy to use because it can be manipulated like any list in R.

Input으로 gene x sample 형태의 Count matrix 를 받고, Output으로 x$counts x$samples (x$samples$group x$samples$group x$samples$norm.factors) x$samples. group을 정해주지 않아서 숫자형태 를 내놓음 2) filterByExpr > Computer Cost 를 줄이기 위해 worthwhile Genes 만 추리게 됨 (t...