Seurat - Integration

Integration 시 features 의 수를 지정하게 되고 그 결과 assay 에 따라 features의 수가 다르다. > dim(GetAssayData(object=Plasma, slot="data",assay="integrated")) [1] 2000 2551 > dim(GetAssayData(object=Plasma, slot="data",assay="RNA")) [1] 33694 2551 그럼 features 의 변화가 있을까? 가 궁금했고 이를 확인해보았다. > GetAssayData(object=Plasma, slot="counts",assay="RNA")[c(23873, 23866, 32546),c(1,3:10)] 3 x 9 sparse Matrix of class "dgCMatrix" C69_AACATATGTCCTCG-1 C69_AACCTTACGCTCCT-1 C69_AAGATTACGAGGAC-1 IGHM 1 1 .

IGHGP . 3 1 IGLL5 . . . C69...