Expression matrix Calculate Adjacency matrix Calculate TOM Similarity matrix WGCNA 논문에서 adjacency matrix에 대해 살펴보면 아래와 같다. P.
Langfelder, S. Horvath, WGCNA: an R package for weighted correlation network analysis, BMC Bioinfo, 9, 559 (2008) 정리하자면 Expression data matrix 에서 수학적인 계산 방법으로 scale-free network 형태로 변환시켜 적절한 adjacency matrix 를 찾아간다. adjacency matrix를 계산하는 방법은 간단하게도 |cor(genei, genej)|Power of scale-free topology 인데 Power of scale-free topology 중 그중 scale free 가 무엇인지 알아보자.
Scale-free networ...
원문 링크 : WGCNA-1, scale free network
