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genotypes or sequence reads로 인종을 추적하는 방법(TRACE)

 genotypes or sequence reads로 인종을 추적하는 방법(TRACE)

doi: 10.1093/bioinformatics/btx075 순서 TRACE 한줄요약 Abstract TRACE 한줄요약 : KNN 방법으로 인종을 추적하는 방법 Abstract : 여러가지 다른 연구들의 조상(인종)에 대해 직접적인 비교가 가능할 수 있도록 만들어진 방법으로, 샘플 당 genotype or sequence data만 있다면 비교가 가능하다. Genetic level에서 "TRACE"라는 도구가 필요한 이유는 인종의 다양성 때문이다.

우리나라의 경우 대부분 east asian으로 이루어져 있지만, European 또는 America의 경우 다양한 인종들이 함께 모여 산다. 함께 산다고 하더라도 유전적으로는 서로 다를 수 있는데, 대표적인 예시로 아래에 1000Genome project의 PCA plot을 본다면, 인종에 따라 서로 다른 cluster를 이루는 것을 볼 수 있다.

곧 인종에 따라 genotype 정보가 상이한 것을 알 수 있는데, 인종의 정보를 모르는...