순서 한줄요약 LD와 D'과 R2란? D'과 R2 계산 수식 D'과 R2 의 차이 한줄 요약 : R2 : 대립유전자까지 같이 유전됨, D' : 같이 유전됨 LD와 D'과 R2란?
부,모로 부터 받은 유전변이(SNP)들은 블럭처럼 뭉텅이로 유전되며, 이로 인해 유전변이들이 서로 독립적으로 유전되지 않는 현상을 Linkage Eisequilibrium(LD)란 연관 불균형이라고 한다. 더 자세한 설명은 GWAS란?
참조 유전변이들의 상관관계를 수치로 설명하는 것이 D'(D-prime)과 R2(R-square)다. D'과 R2 계산 수식 이전 포스팅에 기재해두었으니 궁금하신 분들은 아래 이미지를 토대로 따라해보시길 추천한다.
D'과 R2 계산 수식 참조 R-sq = 1 D' = 1 Haplotype Frequency Expectation under LE --------- --------- -------------------- AC 0.4655 0.216690 GC 0 0.248810 AA...
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Dprime
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D와R차이
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LD
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LinkageDisequilibrium
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R2
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연관불평형
원문 링크 : D-prime(D') 과 R-square(R2)의 차이
