순서 한줄요약 Normalization 과정 한줄요약 Allele specific intensities are normalized using Gencall algorithm Normalization 과정 Illumina의 probe design(bead type)에 따라 infinium1, infinium2 로 나뉘는데 서로 상이한 probe design 때문에 infinium1이 커버하는 loci와 infinium2가 커버하는 loci는 별도의 구간으로 나뉘어 normalization이 진행된다. Normalization 구간 내 loci의 수가 적은 경우(<192 loci), normalization 과정에 부정적인 영향을 미칠 수 있음.
Infinium1,2의 probe design에 대한 설명은 이전 포스팅에 정리해두었다. DNA 메틸화 분석 기초 원리 (Microarray) Reference : doi: 10.1186/1471-2105-9-409 gentrain-tech-n...
