곰팡이가 인체에 미치는 영향은 단순한 알레르기 반응에 그치지 않는다. 이차 대사산물인 마이코톡신은 세포막을 파괴하고 산화 스트레스를 유발하여 호흡기 상피 세포막의 지질을 과산화시키면서 세포벽을 무너뜨린다. 그 결과 DNA 손상이 일어나고 장기 노출 시 세포 사멸이 촉진된다. 또한 면역 시스템이 교란되어 곰팡이 포자는 대식세포를 자극해 사이토카인을 과도하게 분비시키고, 신체를 만성 염증 상태로 만들어 감염병에 대한 저항력이 급격히 떨어진다.
신경계에도 타격이 가능하다. 특히 블랙 몰드에서 배출되는 독소는 후각 신경을 통해 뇌로 직접 전달될 수 있어 기억력 저하와 브레인 포그 현상의 원인이 된다. 이러한 신경계 침투 경로는 중추 신경계의 기능 저하와 집중력 저하를 야기하며 일상 생활의 질에 영향을 미친다.
일반인에게 불편함으로 남는 곰팡이 노출도 특정 환자군에서 치명적 악영향으로 다가올 수 있다. 호흡기 질환 환자(천식, COPD)에게는 곰팡이 포자가 초미세먼지보다 작아 폐포 깊숙이 침투하고 기도를 수축시켜 발작적인 기침을 유발하며 폐 기능을 영구적으로 저하시킨다. 외인성 알레르기성 폐포염의 직접적인 원인이 되기도 한다. 면역 저하자(항암 치료, 이식 환자)에서는 Aspergillus 균이 폐에 들어가 침습성 아스페르길루스증을 일으켜 혈관을 타고 전신으로 퍼지는 치명적인 질환이 되어 사망률이 매우 높다. 아토피 및 피부 질환 환자에서는 곰팡이 포자가 피부 장벽을 뚫고 들어가 가려움증을 유발하고 긁어서 생긴 상처에 2차 세균 감염을 일으키며, 쾌적한 습도 조절 없이는 연고의 효과를 저하시킨다.
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