FFPE (포르말린 고정 파라핀 포매) 샘플에서 DNA, RNA를 성공적으로 추출하는 팁!

병리학적 분석이나 분자 진단 분야에서 귀중한 자원이 되는 FFPE 샘플. 그러나 이 고정 및 포매 과정은 핵산의 손상을 유발해, 추출이 아주 까다롭습니다.

이번 포스팅에서는 FFPE 조직에서 DNA와 RNA를 효과적으로 추출하기 위한 주요 포인트들에 대해 알아보겠습니다. 1. 포르말린 고정으로 인한 가교 결합 (Cross-linking) 포르말린은 단백질과 핵산 사이, 혹은 핵산 상호 간의 가교를 유도하여 구조를 안정화합니다.

이로 인해 추출 후에도 DNA/RNA가 단편화되어 있거나 효율적으로 회수되지 않는 경우가 많습니다. 2. 파라핀의 존재 파라핀을 완전히 제거하지 않으면, 추출 효율뿐 아니라 이후의 PCR, RT-qPCR, NGS 등의 실험에 심각한 영향을 줄 수 있습니다. 3. ️

부분적으로 분해된 핵산 FFPE 보관 기간이 길어질수록 RNA의 분해가 심해져, intact RNA 확보가 더욱 어려워집니다. 확실한 파라핀 제거: xylene 또는 대체 용매를 활용해 충분한 ...