크리스퍼 엄선경 세균은 박테리오파지와 같은 외부 DNA가 침입하면 방어기전으로 핵산분해효소인 Cas 단백질을 합성하여 침입한 외부 DNA를 절단하며 이 중 20여 쌍의 염기서열을 자신의 DNA의 CRISPR 구조에 결합시켜 저장한다. 후에 동일한 염기서열을 가진 외부 DNA가 다시 침입하면 CRISPR 구조로부터 긴 RNA가 전사되고 전사된 후 변형되어 회문구조를 가진 tracrRNA와 외부 DNA의 일부 염기서열을 포함하고 있는 crRNA가 만들어진다.
이들 두 RNA를 합쳐서 Guide RNA라고 부르기도 한다. crRNA/trancrRNA/Cas9 complex를 형성하여 crRNA의 염기서열과 일치하는 20여 쌍의 외부 DNA를 찾아 결합한다. 이때 Cas9 핵산분해효소는 PAM 염기서열을 인지하여 20여 쌍의 염기서열 중 앞쪽 3번째에 해당하는 부위의 DNA 이중가닥을 모두 절단하여 제거한다.
PAM은 Cas9이 유래한 세균의 종류에 따라 인지하는 염기서열이 달라지는데 가장...
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